Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab20P35295 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab20P35295 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab20P35295 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab20P35295 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab20P35295 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab20P35295 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab20P35295 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab20P35295 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab20P35295 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab20P35295 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms