Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pou3f3P31361 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pou3f3P31361 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pou3f3P31361 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pou3f3P31361 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms