Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnga1P29974 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Cnga1P29974 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cnga1P29974 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cnga1P29974 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cnga1P29974 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms