Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc6a9P28571 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc6a9P28571 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc6a9P28571 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms