Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnna1P26231 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctnna1P26231 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctnna1P26231 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms