Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NdnP25233 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NdnP25233 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NdnP25233 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NdnP25233 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NdnP25233 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NdnP25233 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NdnP25233 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NdnP25233 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NdnP25233 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NdnP25233 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NdnP25233 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NdnP25233 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NdnP25233 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NdnP25233 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NdnP25233 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NdnP25233 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NdnP25233 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NdnP25233 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NdnP25233 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NdnP25233 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NdnP25233 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NdnP25233 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NdnP25233 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NdnP25233 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NdnP25233 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NdnP25233 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NdnP25233 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NdnP25233 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NdnP25233 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NdnP25233 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NdnP25233 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NdnP25233 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NdnP25233 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NdnP25233 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NdnP25233 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NdnP25233 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NdnP25233 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NdnP25233 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NdnP25233 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NdnP25233 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NdnP25233 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NdnP25233 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NdnP25233 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NdnP25233 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NdnP25233 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NdnP25233 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NdnP25233 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NdnP25233 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NdnP25233 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms