Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsta3P23591 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsta3P23591 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsta3P23591 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms