Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klra1P20937 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klra1P20937 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klra1P20937 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klra1P20937 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klra1P20937 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klra1P20937 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klra1P20937 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klra1P20937 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klra1P20937 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms