Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc2P20801 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc2P20801 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnnc2P20801 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnnc2P20801 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms