Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb9P20615 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb9P20615 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb9P20615 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms