Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RargP18911 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RargP18911 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RargP18911 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RargP18911 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RargP18911 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RargP18911 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RargP18911 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RargP18911 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RargP18911 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RargP18911 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RargP18911 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RargP18911 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RargP18911 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RargP18911 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RargP18911 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RargP18911 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RargP18911 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RargP18911 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RargP18911 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RargP18911 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RargP18911 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RargP18911 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RargP18911 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RargP18911 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RargP18911 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RargP18911 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RargP18911 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RargP18911 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RargP18911 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RargP18911 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RargP18911 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RargP18911 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RargP18911 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RargP18911 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RargP18911 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RargP18911 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RargP18911 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RargP18911 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RargP18911 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RargP18911 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RargP18911 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RargP18911 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RargP18911 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RargP18911 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RargP18911 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RargP18911 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RargP18911 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RargP18911 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RargP18911 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RargP18911 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RargP18911 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RargP18911 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RargP18911 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RargP18911 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RargP18911 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RargP18911 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RargP18911 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RargP18911 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RargP18911 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RargP18911 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RargP18911 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RargP18911 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RargP18911 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RargP18911 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RargP18911 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RargP18911 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RargP18911 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RargP18911 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RargP18911 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RargP18911 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RargP18911 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RargP18911 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RargP18911 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RargP18911 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RargP18911 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RargP18911 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RargP18911 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms