Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cxcl9P18340 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cxcl9P18340 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl9P18340 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cxcl9P18340 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl9P18340 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl9P18340 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcl9P18340 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms