Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmga1P17095 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmga1P17095 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmga1P17095 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmga1P17095 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms