Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sptan1P16546 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sptan1P16546 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sptan1P16546 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms