Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Q9P14431 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q9P14431 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q9P14431 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q9P14431 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q9P14431 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q9P14431 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms