Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calb1P12658 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Calb1P12658 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calb1P12658 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calb1P12658 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb1P12658 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calb1P12658 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms