Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa1P11477 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa1P11477 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa1P11477 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa1P11477 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms