Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Schip1P0DPB4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Schip1P0DPB4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Schip1P0DPB4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms