Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CatspereP0DP43 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CatspereP0DP43 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CatspereP0DP43 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CatspereP0DP43 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms