Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ly6c2P0CW03 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6c2P0CW03 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c2P0CW03 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms