Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Alkbh1P0CB42 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Alkbh1P0CB42 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh1P0CB42 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms