Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa5P09021 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa5P09021 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms