Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TtrP07309 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtrP07309 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtrP07309 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtrP07309 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtrP07309 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtrP07309 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtrP07309 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtrP07309 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtrP07309 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtrP07309 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtrP07309 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtrP07309 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtrP07309 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtrP07309 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtrP07309 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtrP07309 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtrP07309 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TtrP07309 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtrP07309 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtrP07309 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtrP07309 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtrP07309 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtrP07309 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtrP07309 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtrP07309 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtrP07309 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtrP07309 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtrP07309 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtrP07309 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtrP07309 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtrP07309 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtrP07309 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtrP07309 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtrP07309 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtrP07309 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtrP07309 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtrP07309 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtrP07309 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtrP07309 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtrP07309 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtrP07309 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtrP07309 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtrP07309 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TtrP07309 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtrP07309 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtrP07309 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TtrP07309 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtrP07309 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtrP07309 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtrP07309 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtrP07309 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtrP07309 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtrP07309 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtrP07309 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TtrP07309 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtrP07309 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtrP07309 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtrP07309 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtrP07309 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtrP07309 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtrP07309 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TtrP07309 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TtrP07309 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtrP07309 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtrP07309 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtrP07309 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtrP07309 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtrP07309 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtrP07309 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtrP07309 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtrP07309 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtrP07309 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtrP07309 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TtrP07309 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtrP07309 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms