Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn3P06796 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csn3P06796 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn3P06796 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms