Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Got1P05201 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Got1P05201 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Got1P05201 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Got1P05201 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Got1P05201 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Got1P05201 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Got1P05201 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Got1P05201 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Got1P05201 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Got1P05201 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Got1P05201 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Got1P05201 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Got1P05201 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Got1P05201 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Got1P05201 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Got1P05201 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Got1P05201 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Got1P05201 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Got1P05201 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Got1P05201 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Got1P05201 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Got1P05201 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Got1P05201 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Got1P05201 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Got1P05201 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Got1P05201 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Got1P05201 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Got1P05201 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Got1P05201 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Got1P05201 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Got1P05201 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Got1P05201 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Got1P05201 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Got1P05201 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Got1P05201 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Got1P05201 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Got1P05201 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Got1P05201 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Got1P05201 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Got1P05201 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Got1P05201 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Got1P05201 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Got1P05201 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Got1P05201 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Got1P05201 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Got1P05201 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Got1P05201 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Got1P05201 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Got1P05201 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Got1P05201 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Got1P05201 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Got1P05201 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Got1P05201 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Got1P05201 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Got1P05201 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Got1P05201 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Got1P05201 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Got1P05201 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Got1P05201 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Got1P05201 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Got1P05201 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Got1P05201 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Got1P05201 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Got1P05201 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Got1P05201 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Got1P05201 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Got1P05201 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Got1P05201 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Got1P05201 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Got1P05201 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Got1P05201 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Got1P05201 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms