Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AfpP02772 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AfpP02772 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AfpP02772 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AfpP02772 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AfpP02772 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AfpP02772 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AfpP02772 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AfpP02772 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AfpP02772 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AfpP02772 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AfpP02772 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AfpP02772 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AfpP02772 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AfpP02772 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AfpP02772 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AfpP02772 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AfpP02772 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AfpP02772 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AfpP02772 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AfpP02772 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AfpP02772 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AfpP02772 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AfpP02772 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AfpP02772 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AfpP02772 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AfpP02772 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AfpP02772 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AfpP02772 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AfpP02772 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AfpP02772 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AfpP02772 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AfpP02772 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AfpP02772 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AfpP02772 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AfpP02772 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AfpP02772 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AfpP02772 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AfpP02772 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AfpP02772 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AfpP02772 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AfpP02772 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AfpP02772 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AfpP02772 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AfpP02772 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AfpP02772 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AfpP02772 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AfpP02772 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AfpP02772 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AfpP02772 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AfpP02772 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AfpP02772 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AfpP02772 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AfpP02772 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AfpP02772 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AfpP02772 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AfpP02772 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AfpP02772 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AfpP02772 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AfpP02772 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AfpP02772 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AfpP02772 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AfpP02772 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AfpP02772 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AfpP02772 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AfpP02772 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AfpP02772 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AfpP02772 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AfpP02772 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AfpP02772 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AfpP02772 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AfpP02772 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AfpP02772 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AfpP02772 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AfpP02772 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AfpP02772 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AfpP02772 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AfpP02772 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AfpP02772 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AfpP02772 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AfpP02772 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AfpP02772 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AfpP02772 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AfpP02772 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AfpP02772 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AfpP02772 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AfpP02772 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AfpP02772 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AfpP02772 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AfpP02772 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AfpP02772 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AfpP02772 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms