Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01738 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01738 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01738 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01738 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01738 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01738 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01738 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01738 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01738 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01738 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01738 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01738 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01738 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01738 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01738 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01738 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01738 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01738 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01738 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01738 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01738 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01738 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01738 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01738 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01738 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01738 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01738 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01738 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01738 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01738 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01738 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01738 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01738 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01738 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01738 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01738 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01738 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01738 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01738 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01738 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01738 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01738 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01738 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01738 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01738 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01738 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01738 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01738 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01738 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01738 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01738 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01738 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01738 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01738 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01738 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01738 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01738 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01738 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms