Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01736 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01736 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01736 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01736 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01736 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01736 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01736 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01736 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01736 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01736 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01736 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01736 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01736 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01736 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01736 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01736 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01736 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01736 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01736 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01736 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01736 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01736 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01736 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01736 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01736 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01736 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01736 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01736 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01736 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01736 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01736 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01736 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01736 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01736 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01736 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01736 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01736 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01736 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01736 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01736 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01736 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01736 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01736 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01736 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01736 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01736 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01736 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01736 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01736 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01736 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01736 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01736 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01736 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01736 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01736 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01736 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01736 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01736 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms