Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4bP01029 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C4bP01029 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4bP01029 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4bP01029 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4bP01029 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4bP01029 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4bP01029 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4bP01029 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C4bP01029 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4bP01029 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4bP01029 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4bP01029 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4bP01029 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4bP01029 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4bP01029 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C4bP01029 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C4bP01029 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C4bP01029 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C4bP01029 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4bP01029 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4bP01029 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C4bP01029 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C4bP01029 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C4bP01029 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4bP01029 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4bP01029 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4bP01029 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C4bP01029 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C4bP01029 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4bP01029 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4bP01029 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4bP01029 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C4bP01029 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4bP01029 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C4bP01029 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4bP01029 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C4bP01029 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C4bP01029 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C4bP01029 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4bP01029 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C4bP01029 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4bP01029 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4bP01029 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C4bP01029 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4bP01029 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C4bP01029 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C4bP01029 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C4bP01029 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C4bP01029 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C4bP01029 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4bP01029 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4bP01029 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4bP01029 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C4bP01029 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C4bP01029 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C4bP01029 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C4bP01029 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C4bP01029 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4bP01029 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C4bP01029 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4bP01029 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C4bP01029 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4bP01029 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4bP01029 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4bP01029 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4bP01029 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C4bP01029 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C4bP01029 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C4bP01029 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C4bP01029 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C4bP01029 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C4bP01029 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C4bP01029 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C4bP01029 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C4bP01029 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C4bP01029 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
C4bP01029 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4bP01029 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4bP01029 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C4bP01029 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C4bP01029 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C4bP01029 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C4bP01029 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C4bP01029 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms