Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odc1P00860 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odc1P00860 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odc1P00860 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odc1P00860 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odc1P00860 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odc1P00860 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odc1P00860 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odc1P00860 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odc1P00860 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odc1P00860 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Odc1P00860 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Odc1P00860 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Odc1P00860 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odc1P00860 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odc1P00860 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Odc1P00860 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odc1P00860 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odc1P00860 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms