Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ier5O89113 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ier5O89113 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ier5O89113 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ier5O89113 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ier5O89113 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5O89113 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ier5O89113 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ier5O89113 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ier5O89113 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ier5O89113 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ier5O89113 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ier5O89113 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ier5O89113 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms