Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BlmO88700 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BlmO88700 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
BlmO88700 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BlmO88700 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BlmO88700 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BlmO88700 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BlmO88700 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BlmO88700 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BlmO88700 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BlmO88700 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BlmO88700 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BlmO88700 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BlmO88700 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BlmO88700 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BlmO88700 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BlmO88700 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BlmO88700 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BlmO88700 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BlmO88700 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BlmO88700 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BlmO88700 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BlmO88700 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BlmO88700 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BlmO88700 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BlmO88700 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BlmO88700 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BlmO88700 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BlmO88700 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BlmO88700 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BlmO88700 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BlmO88700 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BlmO88700 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BlmO88700 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BlmO88700 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BlmO88700 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BlmO88700 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
BlmO88700 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
BlmO88700 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BlmO88700 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BlmO88700 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BlmO88700 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BlmO88700 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BlmO88700 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BlmO88700 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BlmO88700 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BlmO88700 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BlmO88700 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BlmO88700 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BlmO88700 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BlmO88700 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BlmO88700 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BlmO88700 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BlmO88700 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BlmO88700 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BlmO88700 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BlmO88700 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BlmO88700 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BlmO88700 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BlmO88700 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BlmO88700 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
BlmO88700 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BlmO88700 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BlmO88700 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BlmO88700 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BlmO88700 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BlmO88700 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BlmO88700 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BlmO88700 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BlmO88700 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BlmO88700 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
BlmO88700 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BlmO88700 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BlmO88700 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BlmO88700 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BlmO88700 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BlmO88700 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BlmO88700 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BlmO88700 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BlmO88700 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BlmO88700 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BlmO88700 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BlmO88700 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BlmO88700 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BlmO88700 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BlmO88700 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BlmO88700 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BlmO88700 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BlmO88700 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BlmO88700 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BlmO88700 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BlmO88700 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BlmO88700 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms