Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ComtO88587 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ComtO88587 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ComtO88587 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ComtO88587 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ComtO88587 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ComtO88587 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ComtO88587 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ComtO88587 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ComtO88587 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ComtO88587 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ComtO88587 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ComtO88587 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ComtO88587 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ComtO88587 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ComtO88587 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ComtO88587 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ComtO88587 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ComtO88587 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ComtO88587 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ComtO88587 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ComtO88587 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ComtO88587 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ComtO88587 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ComtO88587 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ComtO88587 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ComtO88587 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ComtO88587 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ComtO88587 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ComtO88587 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ComtO88587 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ComtO88587 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ComtO88587 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ComtO88587 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ComtO88587 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ComtO88587 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ComtO88587 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ComtO88587 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ComtO88587 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ComtO88587 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ComtO88587 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ComtO88587 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ComtO88587 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ComtO88587 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ComtO88587 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ComtO88587 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ComtO88587 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ComtO88587 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ComtO88587 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ComtO88587 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ComtO88587 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ComtO88587 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ComtO88587 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ComtO88587 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ComtO88587 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ComtO88587 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ComtO88587 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ComtO88587 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ComtO88587 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ComtO88587 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ComtO88587 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ComtO88587 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ComtO88587 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ComtO88587 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ComtO88587 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ComtO88587 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ComtO88587 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ComtO88587 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ComtO88587 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ComtO88587 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms