Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnk4O88454 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk4O88454 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnk4O88454 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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