Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp8O70404 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp8O70404 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms