Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna4O70174 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna4O70174 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna4O70174 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms