Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cavin1O54724 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cavin1O54724 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms