Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd2O35392 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd2O35392 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd2O35392 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxd2O35392 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd2O35392 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms