Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarb2O35114 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarb2O35114 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scarb2O35114 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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