Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Casq2O09161 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq2O09161 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq2O09161 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq2O09161 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casq2O09161 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq2O09161 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq2O09161 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq2O09161 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq2O09161 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq2O09161 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq2O09161 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq2O09161 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq2O09161 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq2O09161 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq2O09161 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq2O09161 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq2O09161 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq2O09161 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189 ms