Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ncoa3O09000 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ncoa3O09000 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ncoa3O09000 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ncoa3O09000 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncoa3O09000 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncoa3O09000 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms