Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Barx2O08686 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Barx2O08686 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Barx2O08686 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Barx2O08686 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Barx2O08686 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Barx2O08686 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms