Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec22bO08547 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22bO08547 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec22bO08547 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms