Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa3bJ9JI28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa3bJ9JI28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa3bJ9JI28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vwa3bJ9JI28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vwa3bJ9JI28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vwa3bJ9JI28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vwa3bJ9JI28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa3bJ9JI28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vwa3bJ9JI28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms