Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8356J3QPD3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm8356J3QPD3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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