Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5814J3QP80 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5814J3QP80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5814J3QP80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5814J3QP80 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5814J3QP80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5814J3QP80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5814J3QP80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5814J3QP80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms