Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5294J3QP53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5294J3QP53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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