Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mfsd4b4J3QNS5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mfsd4b4J3QNS5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms