Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim18J3QNP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim18J3QNP2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim18J3QNP2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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