Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Ccdc180J3QNE4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Ccdc180J3QNE4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Ccdc180J3QNE4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Ccdc180J3QNE4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Ccdc180J3QNE4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC40.76■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
Ccdc180J3QNE4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms